Die Vertretung der fachlichen Interessen der bauindustriellen Unternehmen bestimmter Fachrichtungen wird nach der Satzung des Hauptverbandes in Bundesfachabteilungen (BFAen) wahrgenommen.
Angepasst an die Entwicklung der Technik und des Marktes werden heute 13 BFAen betreut, die ein Spiegelbild des breiten Leistungsspektrums der Bauindustrie bieten und grob in vier Kategorien einzuordnen sind: Hochbau, Tiefbau, Verkehrswegebau und Ausbau.
Die bauindustriell organisierten Firmen können ihrem speziellen Tätigkeitsbereich entsprechend als Mitglied eines Landesverbandes der Bauindustrie direkt in den BFAen mitwirken.
Die gemeinsamen technik-politischen Themen der BFAen werden in der Konferenz ihrer Vorsitzenden, der BFA-Konferenz, koordiniert und in das Präsidium eingebracht.
Querschnittsaufgaben werden zudem durch verschiedene technische Ausschüsse des Hauptverbandes abgedeckt.